Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3caP42337 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pik3caP42337 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms