Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms