Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl12P35979 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl12P35979 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms