Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pola2P33611 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pola2P33611 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pola2P33611 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pola2P33611 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pola2P33611 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pola2P33611 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms