Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nedd1P33215 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms