Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprmP28828 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprmP28828 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprmP28828 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprmP28828 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprmP28828 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprmP28828 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprmP28828 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprmP28828 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprmP28828 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprmP28828 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprmP28828 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
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