Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd247P24161 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd247P24161 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd247P24161 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms