Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6bP23440 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6bP23440 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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