Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RarbP22605 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RarbP22605 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RarbP22605 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RarbP22605 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RarbP22605 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RarbP22605 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RarbP22605 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RarbP22605 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RarbP22605 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RarbP22605 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RarbP22605 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RarbP22605 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RarbP22605 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RarbP22605 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RarbP22605 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RarbP22605 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RarbP22605 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RarbP22605 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RarbP22605 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RarbP22605 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RarbP22605 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RarbP22605 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RarbP22605 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RarbP22605 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RarbP22605 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RarbP22605 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RarbP22605 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RarbP22605 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RarbP22605 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RarbP22605 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RarbP22605 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RarbP22605 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RarbP22605 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RarbP22605 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RarbP22605 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RarbP22605 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RarbP22605 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RarbP22605 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RarbP22605 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RarbP22605 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RarbP22605 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RarbP22605 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RarbP22605 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms