Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnc2P20801 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms