Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prim1P20664 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prim1P20664 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prim1P20664 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms