Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TP20293 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP20293 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP20293 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TP20293 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP20293 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TP20293 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP20293 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TP20293 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP20293 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP20293 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP20293 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP20293 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP20293 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP20293 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP20293 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TP20293 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TP20293 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TP20293 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TP20293 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TP20293 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TP20293 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TP20293 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP20293 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP20293 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms