Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RargP18911 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RargP18911 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RargP18911 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RargP18911 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RargP18911 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RargP18911 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RargP18911 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RargP18911 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RargP18911 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RargP18911 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RargP18911 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RargP18911 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RargP18911 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RargP18911 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RargP18911 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RargP18911 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RargP18911 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms