Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp53P15975 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp53P15975 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp53P15975 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms