Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SptbP15508 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SptbP15508 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SptbP15508 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SptbP15508 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SptbP15508 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SptbP15508 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SptbP15508 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SptbP15508 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SptbP15508 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SptbP15508 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SptbP15508 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SptbP15508 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SptbP15508 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SptbP15508 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SptbP15508 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SptbP15508 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SptbP15508 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SptbP15508 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SptbP15508 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SptbP15508 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SptbP15508 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SptbP15508 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SptbP15508 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SptbP15508 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SptbP15508 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SptbP15508 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SptbP15508 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms