Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb1P12658 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calb1P12658 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calb1P12658 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Calb1P12658 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calb1P12658 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calb1P12658 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb1P12658 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calb1P12658 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb1P12658 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb1P12658 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calb1P12658 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calb1P12658 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calb1P12658 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calb1P12658 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Calb1P12658 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calb1P12658 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Calb1P12658 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calb1P12658 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Calb1P12658 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calb1P12658 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms