Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P10404 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P10404 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P10404 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P10404 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P10404 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P10404 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms