Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms