Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CatspereP0DP43 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms