Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms