Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PrlP06879 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrlP06879 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrlP06879 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrlP06879 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PrlP06879 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrlP06879 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrlP06879 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrlP06879 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrlP06879 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrlP06879 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrlP06879 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrlP06879 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrlP06879 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrlP06879 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PrlP06879 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrlP06879 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrlP06879 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PrlP06879 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrlP06879 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrlP06879 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrlP06879 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrlP06879 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrlP06879 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrlP06879 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PrlP06879 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrlP06879 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrlP06879 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrlP06879 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrlP06879 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrlP06879 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrlP06879 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrlP06879 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms