Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AfmO89020 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AfmO89020 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AfmO89020 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AfmO89020 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AfmO89020 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AfmO89020 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AfmO89020 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfmO89020 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfmO89020 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfmO89020 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AfmO89020 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfmO89020 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfmO89020 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AfmO89020 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AfmO89020 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AfmO89020 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AfmO89020 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AfmO89020 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AfmO89020 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AfmO89020 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AfmO89020 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AfmO89020 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AfmO89020 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AfmO89020 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AfmO89020 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AfmO89020 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms