Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BlmO88700 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BlmO88700 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BlmO88700 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BlmO88700 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BlmO88700 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BlmO88700 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BlmO88700 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BlmO88700 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BlmO88700 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BlmO88700 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BlmO88700 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BlmO88700 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BlmO88700 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BlmO88700 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BlmO88700 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BlmO88700 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BlmO88700 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BlmO88700 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BlmO88700 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BlmO88700 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BlmO88700 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BlmO88700 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BlmO88700 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
BlmO88700 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
BlmO88700 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BlmO88700 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BlmO88700 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
BlmO88700 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BlmO88700 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BlmO88700 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BlmO88700 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BlmO88700 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BlmO88700 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BlmO88700 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BlmO88700 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BlmO88700 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BlmO88700 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BlmO88700 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BlmO88700 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BlmO88700 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BlmO88700 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BlmO88700 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
BlmO88700 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BlmO88700 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BlmO88700 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms