Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm6aO70546 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm6aO70546 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm6aO70546 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms