Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Atp2a2O55143 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms