Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin1O54724 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms