Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Socs1O35716 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Socs1O35716 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs1O35716 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms