Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Scarb2O35114 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Scarb2O35114 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Scarb2O35114 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarb2O35114 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms