Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LhbO09108 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LhbO09108 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LhbO09108 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LhbO09108 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LhbO09108 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LhbO09108 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LhbO09108 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms