Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20939L7N243 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20939L7N243 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms