Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5849J3QPE5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms