Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4bG5E8Z2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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