Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprtnG3X912 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SprtnG3X912 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SprtnG3X912 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SprtnG3X912 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SprtnG3X912 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SprtnG3X912 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SprtnG3X912 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SprtnG3X912 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SprtnG3X912 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SprtnG3X912 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SprtnG3X912 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms