Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LctF8VPT3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LctF8VPT3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LctF8VPT3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LctF8VPT3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LctF8VPT3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LctF8VPT3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LctF8VPT3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LctF8VPT3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LctF8VPT3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LctF8VPT3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LctF8VPT3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms