Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cald1E9QA15 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms