Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga10E9Q6R1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga10E9Q6R1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms