Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms