Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pgbd1E9Q492 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms