Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930579F01RikE9Q3L6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms