Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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