Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms