Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5415E9PXF3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5415E9PXF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms