Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn4E9PX29 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms