Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rsf1E9PWW9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms