Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG8

9530053A07Rik, RIKEN cDNA 9530053A07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 2,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530053A07RikE9PVG8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9530053A07RikE9PVG8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9530053A07RikE9PVG8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms