Protein–RNA interactions for Protein: D3YX02

Gm15293, Predicted gene 15293, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15293D3YX02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm15293D3YX02 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm15293D3YX02 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms