Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30cD3YVI9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms