Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr3aB2RXC6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr3aB2RXC6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms