Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp26c1B2RXA7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp26c1B2RXA7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26c1B2RXA7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms