Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4787B2RUD9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4787B2RUD9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms